Entre sus objetivos específicos están el desarrollo de nuevas estrategias de inmunoterapia contra el cáncer, estudios de endocrinología molecular, reproductiva, fisiopatología, neurobiología, neuroinmunoendocrinología y mecanismos relacionados con enfermedades metabólicas y reproductivas, entre otros.

En resumen, el CEFYBO busca avanzar en la comprensión y desarrollo de nuevos tratamientos en farmacología y ciencias botánicas, con impacto en medicina humana y veterinaria, combinando investigación básica y aplicada, y formando especialistas en estos campos. Su enfoque incluye inmunoterapia, endocrinología, metabolismo y neurobiología, entre otras áreas.